Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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FOXQ1Q9C009 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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FOXQ1Q9C009 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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FOXQ1Q9C009 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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FOXQ1Q9C009 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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FOXQ1Q9C009 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXQ1Q9C009 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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