Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NLRP1Q9C000 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms