Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM54Q9BYV2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms