Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PCGF6Q9BYE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PCGF6Q9BYE7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PCGF6Q9BYE7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCGF6Q9BYE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCGF6Q9BYE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms