Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRIP1Q9BX63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRIP1Q9BX63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRIP1Q9BX63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms