Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAIPQ9BWF2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms