Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REPIN1Q9BWE0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REPIN1Q9BWE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms