Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP58Q9BVL2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms