Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf50Q9BV19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf50Q9BV19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms