Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR3CQ9BUI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3CQ9BUI4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms