Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms