Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UPK3BQ9BT76 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UPK3BQ9BT76 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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UPK3BQ9BT76 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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UPK3BQ9BT76 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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UPK3BQ9BT76 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UPK3BQ9BT76 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UPK3BQ9BT76 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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