Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDFIP1Q9BT67 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDFIP1Q9BT67 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms