Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY3Q9BT09 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms