Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD2Q9BSE4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms