Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM47Q9BQJ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM47Q9BQJ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms