Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT3Q9BQG1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms