Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNS3Q9BQ31 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms