Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHP1Q99653 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms