Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms