Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP19Q99542 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP19Q99542 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms