Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SORT1Q99523 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SORT1Q99523 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms