Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM209Q96SK2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM209Q96SK2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms