Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms