Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP1Q96S65 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP1Q96S65 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms