Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT140Q96RY7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms