Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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