Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCGB3A2Q96PL1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCGB3A2Q96PL1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms