Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD11Q96NU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms