Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF558Q96NG5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms