Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF396Q96N95 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF396Q96N95 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms