Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms