Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00479Q96M42 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00479Q96M42 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms