Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNLQ96KJ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNLQ96KJ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms