Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC11Q96J66 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC11Q96J66 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC11Q96J66 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC11Q96J66 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC11Q96J66 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC11Q96J66 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC11Q96J66 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC11Q96J66 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms