Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHDQ96IW2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms