Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM3Q96HU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms