Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms