Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms