Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD1Q96GM5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms