Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF185Q96GF1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RNF185Q96GF1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF185Q96GF1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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