Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALML4Q96GE6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms