Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGF29Q96ES7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGF29Q96ES7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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