Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSUN4Q96CB9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms