Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG2BQ96BY7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG2BQ96BY7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms