Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN23Q96B33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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