Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms