Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSMEM1Q8WWF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSMEM1Q8WWF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms