Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPPL3Q8TCT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPPL3Q8TCT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms