Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATL2Q8NHH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms